São 41 os Secretários de Estado que fazem parte do Governo de António Costa. Os Secretários de Estado tomaram posse a 26 de novembro de 2015.
Secretários de Estado do Governo de António Costa
Presidência do Conselho de Ministros
- Secretária de Estado adjunta do primeiro-ministro – Mariana Vieira da Silva
- Secretário de Estado dos Assuntos Parlamentares – Pedro Nuno Santos
- Secretário de Estado das Autarquias Locais: Carlos Miguel
- Secretária de Estado para a Cidadania e a Igualdade: Catarina Marcelino
Ministério das Finanças
- Secretário de Estado Adjunto, do Tesouro e das Finanças: Ricardo Mourinho Félix
- Secretário de Estado dos Assuntos Fiscais: Fernando Rocha Andrade
- Secretário de Estado do Orçamento: João Leão
- Secretária de Estado da Administração e do Emprego Público: Carolina Ferra
Ministério dos Negócios Estrangeiros
- Secretária de Estado dos Assuntos Europeus: Margarida Marques
- Secretária de Estado dos Negócios Estrangeiros e da Cooperação: Teresa Ribeiro
- Secretário de Estado das Comunidades: José Luís Carneiro
- Secretário de Estado da Internacionalização: Jorge Oliveira
Ministério da Defesa Nacional
- Secretário de Estado da Defesa: Marcos Perestrelo
Ministério da Administração Interna
- Secretária de Estado Adjunta e da Administração Interna: Isabel Oneto
- Secretário de Estado da Administração Interna: Jorge Gomes
Ministério da Justiça
- Secretária de Estado Adjunta e da Justiça: Helena Mesquita Ribeiro
- Secretária de Estado da Justiça: Anabela Pedroso
Ministério da Economia
- Secretário de Estado Adjunto e do Comércio: Paulo Ferreira
- Secretário de Estado da Indústria: João Vasconcelos
- Secretária de Estado do Turismo: Ana Mendes Godinho
- Secretário de Estado da Energia: Jorge Seguro
Ministério da Agricultura, Florestas e Desenvolvimento Rural
- Secretário de Estado da Agricultura e Alimentação: Luís Medeiros Vieira
- Secretário de Estado das Florestas e do Desenvolvimento Rural: Amândio Torres
Ministério do Mar
- Secretário de Estado das Pescas: José Apolinário
Ministério do Planeamento e das Infraestruturas
- Secretário de Estado do Desenvolvimento e Coesão: Nelson de Souza
- Secretário de Estado das Infraestruturas: Guilherme Waldemar d'Oliveira Martins
Ministério do Ambiente
- Secretário de Estado Adjunto e do Ambiente: José Mendes
- Secretário de Estado do Ambiente: Carlos Martins
- Secretária de Estado do Ordenamento do Território e da Conservação da Natureza: Célia Ramos
Ministério da Saúde
- Secretário de Estado Adjunto da Saúde: Fernando Araújo
- Secretário de Estado da Saúde: Manuel Delgado
Ministério da Educação
- Secretária de Estado Adjunta e da Educação: Alexandra Leitão
- Secretário de Estado da Educação: João Costa
- Secretário de Estado da Juventude e do Desporto: João Wengorovius Meneses
Ministério do Trabalho, Solidariedade e Segurança Social
- Secretário de Estado do Emprego: Miguel Cabrita
- Secretária de Estado da Segurança Social: Cláudia Joaquim
- Secretária de Estado da Inclusão das Pessoas com Deficiência: Ana Sofia Antunes
Ministério da Presidência e da Modernização Administrativa
- Secretário de Estado da Presidência do Conselho de Ministros: Miguel Prata Roque
- Secretária de Estado da Modernização Administrativa: Graça Fonseca
Ministério da Cultura
- Secretária de Estado da Cultura: Isabel Botelho Leal
Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior
- Secretária de Estado da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior: Maria Fernanda Rollo
